سیترات (پرو-3S)-لیاز: آنزیمی حیاتی در تجزیه سیترات
آنزیم سیترات (پرو-3S)-لیاز (Citrate (pro-3S)-lyase) واکنشی شیمیایی را کاتالیز میکند که طی آن، سیترات به مولکولهای استات و اگزالواستات تجزیه میشود:
citrate → acetate + oxaloacetate
این آنزیم به خانواده لیازها (lyases) تعلق دارد، به طور مشخص در زیرگروه اکسو-اسید-لیازها (oxo-acid-lyases) قرار میگیرد. لیازها آنزیمهایی هستند که پیوندهای کربن-کربن را میشکنند. نام رسمی این دسته از آنزیمها سیترات اگزالواستات-لیاز (تشکیلدهنده استات از گروه پرو-S کاربوکسیمتیل سیترات) است.
نامهای رایج دیگری که برای این آنزیم به کار میروند عبارتند از:
- سیتر از (Citrase)
- سیتراتاز (Citratase)
- سیترتیاز (Citritase)
- سیتردسمولاز (Citridesmolase)
- سیترات آلدولاز (Citrate aldolase)
- سیتریک آلدولاز (Citric aldolase)
- سیترات لیاز (Citrate lyase)
- سیترات اگزالواستات-لیاز (Citrate oxaloacetate-lyase)
- سیترات اگزالواستات-لیاز [(پرو-S)-CH2COO→ استات] (Citrate oxaloacetate-lyase [(pro-S)-CH2COO-->acetate])
این آنزیم در مسیرهای بیولوژیکی مهمی مانند چرخه سیترات (که به چرخه کربس نیز معروف است) و همچنین در سیستم دو جزئی عمومی (two-component system - general) نقش دارد.
مطالعات ساختاری
تا اواخر سال 2007، ساختار 4 آنزیم از این دسته با استفاده از روشهایی مانند کریستالوگرافی پرتو ایکس تعیین شده است. کدهای دسترسی مربوط به این ساختارها در پایگاه داده پروتئین (PDB) عبارتند از:
- 1I0I
- 1Q4F
- 2GP0
- 2GP1
ارجاعات
اطلاعات بیشتر و ارجاعات علمی در مورد این آنزیم در پایگاههای داده معتبر موجود است.
کد EC: 4.1.3
این کد نشاندهنده تعلق آنزیم به کلاس 4 (لیازها)، زیرکلاس 1 (برشدهندههای کربن-کربن) و زیرگروه 3 (اکسو-اسید-لیازها) است.
آنزیمهای با ساختار شناخته شده
پایگاه داده PDB حاوی اطلاعات ساختاری دقیق و مدلهای سهبعدی برای این دسته از آنزیمها است که درک چگونگی عملکرد آنها را تسهیل میکند.