9 مقاله
اسمبل de novo ترانسکریپتوم روشی برای ایجاد ترانسکریپتوم بدون استفاده از ژنوم مرجع است. این روش با پیشرفت فناوری توالییابی و کاهش هزینهها، به ابزاری قدرتمند برای مطالعه ارگانیسمهای غیرمدل تبدیل شده است. با این روش میتوان پروتئینهای جدید و ایزوفرمهای آنها را کشف کرد که در پدیدههای بیولوژیکی منحصر به فرد دخیل هستند.
ژن C10orf35 یک پروتئین تراغشایی در انسان کدگذاری میکند که حاوی دامنه عملکرد ناشناخته DUF4605 است. این ژن در کروموزوم ۱۰ قرار دارد و پروتئین آن در مغز، نخاع و اندامهای تناسلی مردانه به میزان بالایی بیان میشود. ساختار پروتئین شامل مناطق حفظشده و بخشهای مارپیچی و ورقهای است.
آرانای کوچک MicX (پیشتر A10) یک آرانای غیرکدکننده در باکتری ویبریو کلرا است که نقش تنظیمکننده منفی پروتئینهای غشایی و تراپورتورهای ABC را بر عهده دارد. این آرانای از طریق بیوانفورماتیک شناسایی شد و الگوی بیان آن تحت تأثیر عوامل مختلفی مانند غنای محیط و حضور پروتئین Hfq قرار میگیرد.
کنفرانس اروپایی زیستشناسی محاسباتی (ECCB) گردهمایی علمی در زمینه زیستشناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک است. این کنفرانس طیف وسیعی از رشتهها را پوشش میدهد و سالانه در شهرهای مختلف اروپا برگزار میشود. از سال ۲۰۰۷، هر دو سال یکبار بهصورت مشترک با کنفرانس سیستمهای هوشمند در زیستشناسی مولکولی (ISMB) برگزار میگردد.
موتیف آرانای FuFi-1 یک ساختار آرانای محافظتشده است که از طریق بیوانفورماتیک کشف شده است. این موتیف در باکتریهای باسیوتا و فوزوباکتریوتا یافت میشود و گاهی در نزدیکی ژنهای کدکننده پروتئینهای XRE-مانند قرار دارد. با این حال، ارتباط زیستشناختی این نزدیکی هنوز مشخص نیست.
CADgene یک پایگاه داده جامع است که ژنهای مؤثر بر بیماری عروق کرونر (CAD) را دستهبندی و تحلیل میکند. این پایگاه داده، اطلاعات ژنهایی را که بر سیستم ایمنی، التهاب، سلامت عروقی و متابولیسم لیپیدها تأثیر میگذارند، گردآوری کرده است.
یوروکربدیبی یک پروژه اروپایی برای ساخت نرمافزارها و استانداردهایی بود که دادههای ساختاری و آزمایشگاهی کربوهیدراتها را گردآوری میکرد. این سامانه پس از توقف در ۲۰۱۰، در یونیکربدیبی ادامه یافت.
بیبلیوم به مجموعهٔ پیکرهٔ متون زیستی گفته میشود و در بیوانفورماتیک برای استخراج الگوها، هدفهای ژنی و سرنخهای دارویی از منابع علمی کاربرد دارد.
ریچارد مو، استاد برجسته ژنتیک محاسباتی و آماری در دانشگاه کالج لندن، سابقه درخشانی در تحقیقات ژنتیک دارد. او در مراکز معتبر علمی مانند مرکز ولکام برای ژنتیک انسانی و دانشگاه آکسفورد فعالیت کرده و در زمینه نقشهبرداری فیزیکی، تعیین توالی DNA و تحلیل آماری ژنتیک پیشگام بوده است.
