جیبوتی در المپیک تابستانی ۲۰۱۶ در ریو دو ژانیرو برزیل از ۵ تا ۲۱ اوت ۲۰۱۶ شرکت کرد. این هشتمین حضور این کشور در المپیک تابستانی بود. تیم جیبوتی شامل هفت ورزشکار (شش مرد و یک زن) در رشتههای دو و میدانی، جودو و شنا رقابت کردند.
آینله سلیمان در دو ۱۵۰۰ متر بسیار نزدیک به کسب مدال بود، اما در نهایت در جایگاه چهارم قرار گرفت. مومین گالا، تنها ورزشکار بازگشته از المپیک لندن، در ماراتن رکورد شخصی خود را با زمان ۲:۱۳:۰۴ ثبت کرد و دوازدهم شد.
جودو
اناس حسین در وزن ۶۶- کیلوگرم جودو شرکت کرد اما در اولین مسابقه حذف شد.
شنا
بورهان ابرو در شنای ۵۰ متر آزاد با زمان ۲۷٫۱۳ ثانیه در رتبه ۷۴ قرار گرفت.