پروتئین C7orf61: ناشناختهای در کروموزوم ۷
پروتئین ناشناخته ناحیه باز کروموزوم ۷ شماره ۶۱ (Uncharacterized protein chromosome 7 open reading frame 61)، که با نام C7orf61 شناخته میشود، پروتئینی با کمبود آسپاراژین در انسان است که توسط ژن c7orf61 کدگذاری میشود. عملکرد دقیق این پروتئین هنوز نسبتاً ناشناخته است، اما در میان پستانداران به شدت حفظ شده است.
ژن
موقعیت ژن
ژن C7orf61 بر روی رشته معکوس (یا منفی) DNA قرار دارد و در کروموزوم ۷ (ناحیه 7q22.1) بین جفت بازهای 100,456,615 تا 100,464,271 واقع شده است که تقریباً ۷,۶۵۶ جفت باز را شامل میشود. این ژن در مجموع دارای ۳ اگزون است و فاقد ایزوفرمهای مختلف است.
mRNA
مولکول mRNA مربوط به این ژن تقریباً ۱۰۱۹ جفت باز طول دارد و به حوزه عملکرد ناشناخته ۴۷۰۳ (DUF4703 یا PFAM15775) تعلق دارد.
پروتئین
ساختار و ویژگیها
در انسان، این پروتئین شامل مجموعاً ۲۰۶ اسید آمینه است. وزن مولکولی پروتئین ۲۳.۷۱ کیلو دالتون (kDa) و نقطه ایزوالکتریک آن ۱۰.۴۱ است. حوزه DUF4703 در موقعیت ۲۲ تا ۲۰۶ اسید آمینه پروتئین قرار دارد. این ژن یا پروتئین، نام مستعار دیگری ندارد، اما در چندین گونه از نخستیها با تمایل بالا یافت میشود.
ترکیب اسید آمینه
ترکیب اسید آمینه پروتئین C7orf61 شامل فراوانی بالای لوسین، سرین و والین باردار است. این پروتئین به طور غیرمعمولی فراوانی پایینی از آسپاراژین دارد، که آن را به یک پروتئین با کمبود آسپاراژین تبدیل میکند. همچنین، فراوانی بالاتری از پیوندهای نمکی بین اسید گلوتامیک، اسید آسپارتیک، لیزین و آرژنین در آن مشاهده میشود.
ساختار ثانویه
پیشبینیهای ساختار ثانویه توسط ابزارهای CFSSP، SSPRED و GOR4 نشان میدهند که ساختار ثانویه این پروتئین عمدتاً از مارپیچهای آلفا (۵۱.۲٪) تشکیل شده است، با مقادیر قابل توجهی کویل (۳۸.۲٪) و بخشهای کوچکتری از رشتههای بتا (۱۰.۳٪).
اصلاحات پساترجمهای
پروتئین C7orf61 دارای چندین جایگاه برای اصلاحات پساترجمهای است که بیشتر آنها شامل کینازهای سرین/ترئونین مانند پروتئین کیناز C، کازئین کیناز II، DNA-dependent protein kinase و Cyclin-dependent kinase 1 میشوند. پیشبینی میشود که این پروتئین دارای یک سیگنال هستهای دوگانه (NLS_BP)، یک حوزه غنی از لوسین (LRV) و یک حوزه شبیه ایمونوگلوبولین باکتریایی (BIG-1) باشد.
موقعیت سلولی
پروتئین C7orf61 هیچ دامنه غشایی یا پپتید سیگنالی ندارد. پیشبینی میشود که این پروتئین در میتوکندری موضعیابی شود و اندکی فعالیت خارج سلولی نیز برای آن نشان داده شده است. تجزیه و تحلیل گستردهتر توالی اسید آمینه KFFRWVRRAWQRIISWVF در نزدیکی انتهای N-ترمینال، نشاندهنده وجود یک سیگنال هدفگیری میتوکندریایی است.
تنظیم ژن
ژن C7orf61 سطوح بالایی از بیان را در بیضه و سطوح پایینتری را در مغز و بافتهای همبند نشان میدهد. بر اساس ارزیابی آزمایشهای میکروآرایه موجود در NCBI Geo، استنباط میشود که بیان ژن c7orf61 تحت تنظیم منفی قرار دارد.
همولوژی
پروتئین C7orf61 هیچ پارالوگ (ژنهای مشابه در همان گونه) ندارد. تجزیه و تحلیل با استفاده از ابزار BLASTt در NCBI نشان داد که این ژن در پستانداران به شدت حفظ شده است و نمیتوان آن را بیش از ۱۶۰ میلیون سال پیش ردیابی کرد. جدول زیر لیستی از ارتوولوگهای (ژنهای همریشه در گونههای مختلف) یافت شده در چندین زیرشاخه پستانداران را نشان میدهد؛ این لیست جامع نیست.
جدول ارتوولوگها (نمونه)
| گونه | نام ژن/پروتئین |
|---|---|
| انسان (Homo sapiens) | C7orf61 |
| میمون رزوس (Macaca mulatta) | LOC494124 |
| سگ (Canis lupus familiaris) | LOC484712 |
| موش (Mus musculus) | C7orf61 |
| گاو (Bos taurus) | LOC518778 |
منابع
(در این مقاله منابع ذکر نشده است.)