ناحیه ۵′ UTR ویروس تومبوس
ناحیه ۵′ UTR ویروس تومبوس، یکی از بخشهای تنظیمی حیاتی (cis-regulatory) در ژنوم این ویروس به شمار میرود.
ویروس کوتولگی بوتهای گوجهفرنگی (Tomato bushy stunt Virus)، عضو شاخص خانواده تومبوسویریده است. ژنوم این ویروس از نوع RNA تکرشتهای با قطب مثبت است و فرایند همانندسازی آن از طریق واسطه RNA با قطب منفی صورت میگیرد. علاوه بر پروتئینهای ویروسی p33 و پلیمراز وابسته به RNA (p92) و همچنین فاکتورهای ناشناخته میزبان، مناطق حفظشده و ساختاری درون ناحیه ترجمهنشده ۵′ (5′ UTR) نقش مهمی در تنظیم همانندسازی ژنوم ایفا میکنند.
ساختار دومینهای RNA در ناحیه ۵′ UTR
تاکنون دو دومین RNA در ناحیه ۵′ UTR شناسایی شده است: یک دومین Tشکل در انتهای ۵′ (TSD) که به دنبال آن یک حلقه ساقهای (SL5) و یک دومین پاییندست (DSD) قرار گرفتهاند. پژوهشگران پیشنهاد کردهاند که تعاملات میان TSD و DSD در میانجیگری همانندسازی RNA ویروسی درگیر هستند.
ویژگی منحصربهفرد: پشتیبانی از همانندسازی DI RNA
یکی از ویژگیهای جالب توجه ویروس تومبوس، توانایی آن در پشتیبانی از همانندسازی RNAهای مداخلهگر معیوب (DI RNAs) است. این رپلیکونهای زیرویروسی، موتانهای حذفی کوچک و غیرکدکنندهای از ژنوم ویروس هستند که عناصر RNA عملکننده در جای خود (cis-acting) لازم برای همانندسازی را حفظ کردهاند.
سایر ساختارهای RNA غیرکدکننده
سایر ساختارهای RNA غیرکدکننده در ویروس تومبوس شامل ناحیه IV در ۳′ UTR و یک عنصر همانندسازی درونی (internal replication element) است.