استرپتومایسس لئوننهوکئی (Streptomyces leeuwenhoekii) گونهای باکتری از سرده استرپتومایسس است که از خاک بیابان فوقخشک سالار دِ آتاکاما در شیلی جدا شده است. این باکتری به دلیل توانایی تولید ترکیبات زیستفعال مانند چاکسالاکتینها و چاکسامایسینها، توجه محققان را به خود جلب کرده است.
این ترکیبات میتوانند در صنایع دارویی و زیستفناوری کاربردهای مهمی داشته باشند. کشف استرپتومایسس لئوننهوکئی در چنین شرایط محیطی سخت، نشاندهنده تنوع زیستی شگفتانگیز میکروارگانیسمها در طبیعت است.
این باکتری به افتخار آنتونی فان لئوننهوک، پدر میکروسکوپی، نامگذاری شده است.