آرتور کون در سال ۱۸۶۲ در فلاتو، پروس غربی، به دنیا آمد. او پسر ربای محلی بود و آموزشهای ربانی خود را در سمینار ربانی هیلدسهایمر در برلین زیر نظر اسریئل هیلدسهایمر گذراند. همزمان، در رشتههای تاریخ و زبانشناسی در دانشگاه برلین تحصیل کرد و زیر نظر تئودور مومسن دکترا گرفت.
از سال ۱۸۸۵ تا پایان عمر، او نخستین ربای ارتدوکس جامعه یهودی باسل سوئیس بود و چندین بار به عنوان ربای تماموقت تأیید شد. پیش از او، این جایگاه توسط ربایانی از هگنهایم اداره میشد. کون همچنین در بسیاری از جوامع یهودی سوئیس فعالیت داشت و در میان جامعه ارتدوکس مورد احترام بود. حدود ۴۰۰ کارت پست او در مجموعه موزه یهودی سوئیس نگهداری میشود که نگاهی به مسائل روزمره یهودیان سوئیس در اوایل قرن بیستم ارائه میدهد.
در نخستین کنگره صهیونیستها در سال ۱۸۹۷، کون سخنرانی کوتاهی ایراد کرد و خواستار اعلام رسمی رابطه صهیونیسم با دین شد. او ابراز امیدواری کرد که «یهودیت ملی دروازهای به سوی یهودیت مذهبی باشد». این سخنرانی با تشویق زیاد همراه شد و تئودور هرتزل اعلام کرد که «صهیونیسم قصد ندارد به باورهای مذهبی هیچ گرایشی در یهودیت آسیب برساند».
کون در ابتدا از صهیونیسم حمایت میکرد، اما حداقل از کنگره دهم صهیونیستها در سال ۱۹۱۱، دیگر صهیونیسم و یهودیت مذهبی را سازگار نمیدید.
آرتور کون پدربزرگ آرتور کون، تهیهکننده فیلم، بود.