پروتئین ریبوزومی L41 میتوکندریایی، که توسط ژن MRPL41 کدگذاری میشود، در فرآیند سنتز پروتئین درون میتوکندری نقش دارد. این پروتئین بخشی از زیرواحد 39S ریبوزوم میتوکندریایی است.
ریبوزومهای میتوکندریایی (میتوریبوزومها) در پستانداران از دو زیرواحد 28S و 39S تشکیل شدهاند. ترکیب آنها حدود 75 درصد پروتئین و 25 درصد RNA ریبوزومی (rRNA) است، در حالی که در ریبوزومهای پروکاریوتها این نسبت برعکس است. همچنین، ریبوزومهای پروکاریوتها دارای rRNA 5S هستند که در میتوریبوزومها وجود ندارد.
توالی پروتئینهای تشکیلدهنده میتوریبوزومها در بین گونههای مختلف تفاوت قابلتوجهی دارد و گاهی اوقات خواص بیوشیمیایی آنها نیز متفاوت است. این تفاوتها شناخت آنها از طریق همترازی توالی را دشوار میکند.