فصل ۲۰۰۶، نخستین سال فعالیت باشگاه فوتبال ججو یونایتد بهعنوان یک فرانچایز جدید بود. این باشگاه در لیگ کی (K-League) رتبه سیزدهم را کسب کرد و در ۲۶ بازی، ۵ برد، ۱۰ تساوی و ۱۱ باخت به دست آورد. ججو یونایتد در جام کی (K-League Cup) نیز رتبه هشتم را کسب کرد و در جام حذفی کره جنوبی (FA Cup) تا مرحله یکشانزدهم صعود کرد.
آمار فصل ۲۰۰۶ ججو یونایتد
| فصل | لیگ کی | بازیها | برد | تساوی | باخت | گل زده | گل خورده | امتیاز | جام کی | جام حذفی | سرمربی |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ۲۰۰۶ | سیزدهم | ۲۶ | ۵ | ۱۰ | ۱۱ | ۲۳ | ۳۰ | ۲۵ | هشتم | مرحله یکشانزدهم | جونگ هه-سونگ |